Osnovan 1953, Albanološki Institut se preselio na univerzitetski kampus 1977. i bio je poslednja albanska institicuja koja je zatvorena. Na početku 1990. Institut je podržavao Kampanju Pomirenja krvnih osveta, pokret koji su širom države pokrenuli studenti i bivši politički zatvorenici. Anton Četa i Zekerija Cana, oboje učenjaci na Institutu koji su znali kako funkcioniše komunikacijski stil oda (odaja), podržali su proces posredništva slučaj po slučaj. Zatvaranje Instituta 1994. je bilo ispraćeno neopisivim nasiljem. Ipak, godišnje akademske novine, Gjurmime Albanologjike [Albanološke Studije], koje se objavljuju od 1971, nastavile su sa radom pod surovim uslovima bez finansiranja i infrastrukture. Nakon posredništva katoličkog udruženja St. Egidio, postignut je dogovor između albanskih političkih predstavnika i Miloševićevog režima. Rezultat toga je bio povratak Albanološkog Instituta u svoju zgradu 1998.